主站房双层设计

改扩建后的厦门火车站，旅客进出模式将调整为双层设计的“高进低出”，上面为出发旅客，下面为到达旅客；并采用高架候车室，设计标准为小时最高峰聚集人数4000人。

南、北两个站房中间是股道，站场规模也由现在的3站台5股道扩大至5站台9股道，列车接待能力大幅提升。同时，厦门火车站改扩建后的人工售票窗口将有36个，自动售票机10台。

建成后，厦门火车站将拥有南、北两个广场，现有的北广场改造后占地1.4万平方米，新增的南广场占地3.2万平方米。南、北广场将形成集铁路、长途汽车、出租车、公交和社会车辆等为一体的城市综合交通枢纽中心。